Hay una solución a esto:
Entiendo que lo que realizaste en su momento es un cifrado de la unidad al completo. Si es así lo mejor es montarla y descifrarla primero, a posteriori realizar un formateo de la unidad al completo. De todas formas si lo que estas usando es Windows, para eliminar sectores (volúmenes) de la unidad para poder tener el espacio al completo puedes hacerlo entrando en:
Esto es en sistemas Windows 7:
- Botón Inicio
- Panel de Control
- Herramientas administrativas
- Administración de Discos (Y pulsas de nuevo en la pestaña administración de discos)
Ahí verás la unidad de 1 TB del disco externo (tenlo enchufado) y podrás seleccionar sectores y eliminarlos pulsando encima al botón derecho del ratón (te saldrá la opción eliminar volumen) lo puedes ver en la imagen de abajo.
Saludos y suerte!