Cuando aparecen dos iconos de Whatsapp puede ser por dos motivo. Uno es que la app se haya duplicado y el otro es que hayas creado por algún motivo un acceso directo sin que te hayas dado cuenta. Para comprobar esto, debes hacer lo siguiente.
Lo primero es que entres en las apps. En el caso de que hayas creado un acceso directo, vas a ver que cuando entras en esa app se abre directamente la conversación con una persona o grupo, desde el que se ha creado el acceso directo. En el caso de que sea así, lo mas seguro es que veas la foto de este chat.
Para poder borrarlo, lo único que debes hacer es mantener pulsado el símbolo y verás que aparece "eliminar". Basta con que lo selecciones que lo quieres borrar y listo.
En el caso de que hayas duplicado la app, lo que debes hacer es en estos casos es eliminar este duplicado. En función del teléfono esto puede variar, asique te voy a dejar cómo puedes hacerlo en varios modelos a ver si alguno de ellos coincide con el tuyo.
En el caso de iPhone, este proceso puede variar.
Muchas veces aparecen dos iconos pero solo funciona uno de ellos. Esto se debe a que es posible que al actualizar la app algo ha sucedido y el icono se ha duplicado. Ya que con uno de ellos no puedes hacer nada, lo mejor es que fuerces el reinicio del teléfono. Te dejo cómo hacer esto en función del modelo.
Este tutorial para modelos más antiguos.
En el caso de que el problema en Android no sea el de la app gemela sino que pase como acabamos de explicar en iPhone, el proceso sería el mismo. Lo que se debe hacer es forzar el reinicio.
Espero que con algo de esto puedas solucionar el problema, saludos.