Hola Rodri,
Según lo que comentas, son dos cuentas independientes a pesar de que una dependa de la otra por lo que la actividad de una no tiene porque aparecer en la otra.
Como bien dices, la zona de mensajes directos por ejemplo es diferente, entonces una persona no puede ver cuando te has conectado en la otra cuenta ya que esto es independiente como te acabo de comentar.
De todos modos si te preocupa tanto esta segunda cuenta, quizás es mejor que la elimines. Te dejo un vídeo de cómo hacerlo por si acaso lo necesites.